Zur Klärung der Entstehungsgeschichte der Grube Messel wurde im Jahr 2001 eine Forschungsbohrung durchgeführt. In einer Tiefe von 240 Meter stieß die Bohrung auf Lapillituffe. Dies beweist, dass die Fossillagerstätte Messel in einem Maarvulkan-See entstand. Bei der Bohrung traf man auf Schwefel- und Eisenreiches Wasser, das heute aus dem zum Brunnen ausgebauten Bohrloch sprudelt.